纪念斯隆凯特琳癌症中心的研究人员表明，自体粪菌移植(auto-粪菌移植) 是一种安全有效的方法，可以帮助在同种异体造血干细胞移植期间需要强效抗生素的癌症患者补充有益的肠道细菌。在他们的研究中，接受手术的患者被随机分为两组：一组接受标准治疗，另一组接受自动粪菌移植。研究人员发现，自动 粪菌移植可使有益肠道细菌在数天内恢复到接近基线水平，从而恢复患者的消化、免疫和其他基本功能。在标准护理下，有益细菌通常需要数周时间才能从抗生素治疗中恢复，使患者面临其他传染病的风险，包括艰难梭菌。

隶属于美国国立卫生研究院的国家过敏症和传染病研究所为该项目的一部分提供了资金。该研究报告发表在《科学转化医学》上。
“这项重要的研究表明，使用自动粪菌移植进行临床干预可以安全地逆转广谱抗生素治疗的破坏性影响，”NIAID 主任 Anthony S. Fauci 医学博士说，“如果在更大规模的研究中得到验证，这种方法可能会被证明是相对一种在强化抗菌治疗后快速恢复人体健康微生物组的简单方法。”
同种异体造血细胞移植涉及捐赠者——通常但不完全是家庭成员——他为接受者提供干细胞，以重建血细胞的骨髓生成和免疫功能以对抗癌症。抗生素对于预防干细胞受体的细菌感染至关重要。然而，抗生素也会破坏增强免疫功能和抵抗感染的有益细菌。有益细菌的丧失会增加某些危及生命的传染病和移植物抗宿主病 (GVHD) 的风险。
该研究涉及癌症患者，他们提供了自己的粪便样本，这些样本在他们的细胞移植程序之前被冷冻和储存。几周后，当医生确认移植的细胞正在生长时，他们评估了患者肠道有益细菌的状态。前25名缺乏已知有益细菌的患者被纳入研究，并随机分配到不同的治疗组：14 名接受灌肠自动粪菌移植，11 名接受标准护理。
接受自动粪菌移植的患者始终恢复细菌多样性、组成和功能；11名对照患者的有益菌恢复延迟。
研究人员正在继续监测研究患者，以确定自动粪菌移植是否能改善患者的预后，例如细菌、病毒和真菌感染的发生率和严重程度，以及 GVHD的发生率和严重程度。来自健康供体的粪菌移植在恢复有益细菌方面是否与患者自己的粪便样本一样有益仍有待研究。