粪菌移植背景

粪便微生物群移植 (FMT) 可治疗艰难梭菌感染 (CDI)。关于 FMT 儿科接受者中发生的抗菌素耐药性 (AMR) 基因和潜在病原体负担的变化知之甚少。

粪菌移植目标

调查儿童 FMT 的 AMR 基因、潜在病原体、物种和功能途径的变化。 方法 9 名患有复发性 CDI 的儿童接受了 FMT。FMT 前和 FMT 后纵向收集供体和受者的粪便长达 24 周。进行了鸟枪法宏基因组测序。使用 PathoScope 2.0 分析读数。

粪菌移植结果

所有儿童都有 CDI 的分辨率。FMT后AMR基因减少（P<0.001），多药耐药基因持续减少（P <0.001）。FMT后四环素抗性基因增加（P <0.001）。在捐赠者和接受者中发现的潜在病原体水平非常低，在 FMT 后总体下降（P <0.001）。普雷沃氏菌属 109 在 FMT 后的所有受者中扩大，没有受者有任何临床感染。FMT 前受者与供者相比，α 多样性较低（P <0.001），而 FMT 后则持续增加（P ≤0.002）。FMT 前后受者样本的 Beta 多样性显着不同（P<0.001)。细菌种类Faecalibacterium prausnitzii和Bacteroides ovatus在 FMT 后的扩增中在供体中的丰度高于受体（分别为P = 0.008 和P = 0.040）。生物合成途径在供体中占主导地位，在 FMT 后受体中增加。

粪菌移植结论

儿童 CDI 的 FMT 可减少 AMR 基因和潜在病原体，并改变微生物群的组成和功能。然而，在 FMT 后获得某些 AMR 基因以及在供体中发现的低水平潜在病原体表明，在 FMT 之前使用宏基因组测序筛选供体方面需要进一步研究。 本文的全文可以通过下面的来源信息访问。